Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apobec1P51908 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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