Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccr5P51682 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms