Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BckdhaP50136 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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