Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VegfbP49766 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VegfbP49766 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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VegfbP49766 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VegfbP49766 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VegfbP49766 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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VegfbP49766 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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VegfbP49766 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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VegfbP49766 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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VegfbP49766 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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VegfbP49766 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VegfbP49766 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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VegfbP49766 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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VegfbP49766 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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