Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx1P48377 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms