Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms