Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms