Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
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