Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TfamP40630 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TfamP40630 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TfamP40630 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TfamP40630 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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