Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Grik2P39087 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms