Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pou3f3P31361 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pou3f3P31361 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pou3f3P31361 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms