Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprmP28828 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprmP28828 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprmP28828 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
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