Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atxn10P28658 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Atxn10P28658 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Atxn10P28658 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Atxn10P28658 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atxn10P28658 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Atxn10P28658 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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