Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Slc6a9P28571 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms