Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hoxd10P28359 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hoxd10P28359 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hoxd10P28359 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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