Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb1P28230 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb1P28230 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb1P28230 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb1P28230 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb1P28230 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb1P28230 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjb1P28230 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb1P28230 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb1P28230 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gjb1P28230 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb1P28230 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb1P28230 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb1P28230 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb1P28230 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gjb1P28230 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb1P28230 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb1P28230 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb1P28230 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb1P28230 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb1P28230 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb1P28230 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb1P28230 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb1P28230 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb1P28230 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb1P28230 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb1P28230 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb1P28230 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb1P28230 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb1P28230 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb1P28230 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb1P28230 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms