Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Pde6aP27664 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Pde6aP27664 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Pde6aP27664 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Pde6aP27664 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Pde6aP27664 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Pde6aP27664 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Pde6aP27664 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pde6aP27664 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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