Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CftrP26361 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CftrP26361 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CftrP26361 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CftrP26361 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CftrP26361 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CftrP26361 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CftrP26361 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CftrP26361 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CftrP26361 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CftrP26361 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CftrP26361 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CftrP26361 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CftrP26361 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CftrP26361 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CftrP26361 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CftrP26361 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CftrP26361 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CftrP26361 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CftrP26361 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CftrP26361 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CftrP26361 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CftrP26361 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CftrP26361 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CftrP26361 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CftrP26361 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CftrP26361 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CftrP26361 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CftrP26361 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CftrP26361 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CftrP26361 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CftrP26361 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CftrP26361 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CftrP26361 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CftrP26361 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CftrP26361 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CftrP26361 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CftrP26361 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CftrP26361 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CftrP26361 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CftrP26361 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CftrP26361 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CftrP26361 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CftrP26361 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CftrP26361 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CftrP26361 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CftrP26361 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CftrP26361 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CftrP26361 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CftrP26361 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CftrP26361 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CftrP26361 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CftrP26361 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CftrP26361 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CftrP26361 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CftrP26361 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CftrP26361 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CftrP26361 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CftrP26361 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CftrP26361 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CftrP26361 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CftrP26361 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CftrP26361 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CftrP26361 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CftrP26361 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CftrP26361 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CftrP26361 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CftrP26361 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CftrP26361 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CftrP26361 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CftrP26361 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CftrP26361 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CftrP26361 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CftrP26361 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CftrP26361 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CftrP26361 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CftrP26361 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CftrP26361 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CftrP26361 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CftrP26361 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CftrP26361 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CftrP26361 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CftrP26361 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CftrP26361 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CftrP26361 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CftrP26361 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CftrP26361 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CftrP26361 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms