Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChgaP26339 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChgaP26339 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ChgaP26339 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChgaP26339 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms