Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PparaP23204 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PparaP23204 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PparaP23204 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PparaP23204 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PparaP23204 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PparaP23204 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms