Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpraP18052 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpraP18052 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpraP18052 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpraP18052 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms