Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gata1P17679 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms