Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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