Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RhoP15409 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RhoP15409 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RhoP15409 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RhoP15409 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RhoP15409 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RhoP15409 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RhoP15409 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RhoP15409 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RhoP15409 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RhoP15409 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RhoP15409 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RhoP15409 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RhoP15409 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhoP15409 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhoP15409 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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