Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms