Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb1P13372 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms