Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms