Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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LtaP09225 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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LtaP09225 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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LtaP09225 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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LtaP09225 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LtaP09225 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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LtaP09225 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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LtaP09225 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LtaP09225 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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