Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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