Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrygdP04342 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CrygdP04342 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CrygdP04342 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms