Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa7P02830 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms