Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

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Length 635 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20bO88575 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Slc6a20bO88575 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Slc6a20bO88575 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Slc6a20bO88575 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a20bO88575 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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