Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops6O88545 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops6O88545 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms