Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms