Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp4O70480 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms