Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copb2O55029 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms