Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SlkO54988 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SlkO54988 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SlkO54988 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SlkO54988 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SlkO54988 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlkO54988 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SlkO54988 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SlkO54988 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SlkO54988 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SlkO54988 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SlkO54988 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SlkO54988 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SlkO54988 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SlkO54988 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SlkO54988 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SlkO54988 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SlkO54988 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SlkO54988 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SlkO54988 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SlkO54988 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SlkO54988 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SlkO54988 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SlkO54988 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SlkO54988 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SlkO54988 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SlkO54988 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SlkO54988 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SlkO54988 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms