Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Lgals6O54891 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms