Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms