Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr1aO35134 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Polr1aO35134 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1aO35134 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms