Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcshO08795 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms