Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3542K7N6U2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3542K7N6U2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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