Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Fam240aJ3QNP9 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Fam240aJ3QNP9 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Fam240aJ3QNP9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Fam240aJ3QNP9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Fam240aJ3QNP9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Fam240aJ3QNP9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Fam240aJ3QNP9 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Fam240aJ3QNP9 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Fam240aJ3QNP9 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Fam240aJ3QNP9 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms