Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20918J3QN17 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms