Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm20830J3KML6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm20830J3KML6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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