Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms