Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r167G3UW71 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms