Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
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H2-M1F7CXU4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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H2-M1F7CXU4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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H2-M1F7CXU4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M1F7CXU4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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H2-M1F7CXU4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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H2-M1F7CXU4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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H2-M1F7CXU4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M1F7CXU4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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