Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rarres1F6ZIS7 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms