Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngap1F6SEU4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms